Клинико — диагностическая лаборатория
Квалификационные категории персонала лаборатории: Среди врачей клинической диагностики: высшая категория — 7, первая — 2.
Среди среднего медицинского персонала: высшая категория — 9, первая — 1, вторая — 1.
Объем клинических и бактериологических исследований выполняется согласно приказам Минздрава России от 21.03.2003 № 109 «О совершенствовании противотуберкулезных мероприятий в Российской Федерации» и от 29.12.2014 № 951 «Об утверждении методических рекомендаций по совершенствованию диагностики и лечения туберкулеза органов дыхания».
В целях мониторинга диагностики туберкулеза разработана и функционирует компьютерная база данных «Бактериологическая лаборатория».
Спектр выполняемых исследований
Исследования с помощью молекулярно-генетических методов
Благодаря повышенному вниманию к проблеме туберкулеза достигнуты значительные успехи в молекулярно-биологических исследованиях микобактерий туберкулеза. Метод ПЦР является наиболее эффективным методом среди методов молекулярной диагностики. Использование этого метода позволяет с высокой степенью специфичности выявить микобактерии в течение короткого срока при наличии 10 клеток в 1 мл. материала и следовательно по своей чувствительности значительно превосходит бактериоскопические и даже культуральные методы. Метод обеспечивает диагностику при сниженной жизнеспособности микобактерий. Некоторые данные свидетельствуют о высокой эффективности ПЦР-анализа для диагностики туберкулеза мочевой системы и туберкулеза мужских половых органов. Быстрота проведения анализа (1-2 дня) чрезвычайно ценна для клинической практики.
Сочетание ПЦР-анализа с культивированием диагностического материала с использованием автоматизированной системы BACTEC MGIT 960 позволяет оценивать эффективность лечения, особенно у больных с ограниченными формами туберкулеза.
На сегодняшний день, одной из важных задач является изучение сочетанного развития туберкулеза и различных инфекций, которые утяжеляют его течение и способствует развитию осложнений. Ведущую роль среди них играют герпес-вирусные инфекции, токсоплазмоз, кандидоз.
Это обусловило, актуальность исследования следующих инфекций методом молекулярной диагностики:
- ДНК вируса простого герпеса 1 и 2 типов;
- ДНК цитомегаловируса;
- ДНК вируса Эпштейн-Барра;
- ДНК candida albicans;
- ДНК toxoplasma gondii;
- ДНК Varicella-Zoster virus.
Исследование новой короновирусной инфекции SARS-coV-2
Возбудитель инфекции — штамм коронавируса 2 типа, вызывающий тяжёлый острый респираторный синдром (ТОРС). Вспышка возникла и вызвала пандемию в конце 2019 г. в г. Ухань Китайской Народной Республики (КНР). ВОЗ присвоила официальное название инфекции COVID-19 («Coronavirus disease 2019»), до этого использовался термин 2019-nCoV. Международный комитет по таксономии вирусов присвоил возбудителю название SARS-CoV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome CoronaVirus-2).
Клинико-диагностическая лаборатория с декабря 2020 года проводит молекулярно-генетические исследования на наличие РНК SARS-CoV-2 методом ОТ- ПЦР.
Общеклинические и гематологические исследования
- Исследование мочи (общий анализ, подсчет форменных элементов по Нечипоренко);
- Исследование спинномозговой жидкости (физические свойства, общий белок – проба Ривальта и др., цитоз, дифференциация клеточных элементов);
- Исследование экссудатов и транссудатов (физические свойства, общий белок — проба Ривальта и др., микроскопическое исследование;
- Исследование кала (копрологическое исследование, обнаружение простейших и гельминтов, исследование на энтеробиоз);
- Исследование эякулята (физические свойства, рН, определение концентрации белка, микроскопическое исследование);
- Исследование выделений женских половых органов (оценка степени чистоты влагалища, обнаружение трихомонад и гонококков в окрашенных препаратах);
- Бактериоскопическое исследование диагностического материала на гистоплазмоз, криптококкоз, криптоспородиоз, пневмоцистоз.
- Гематологические (общий анализ крови с подсчетом лейкоцитарной формулы с описанием морфологии форменных элементов крови.
Биохимические исследования
- Белковый обмен (общий белок, альбумин, мочевина, мочевая кислота, креатинин, специфические белки – С-реактивный белок);
- Углеводный обмен (глюкоза, глюкозо-толерантный тест, гликемический и глюкозурический профили, кетоновые тела в моче);
- Липидный обмен (холестерин);
- Ферментный статус (АЛТ, АСТ, щелочная фосфатаза общая, ГГТП, амилаза крови и мочи);
- Электролитный баланс (К, Na, Са, Cl);
- Пигментный обмен (билирубин).
- Исследование уровня свободного тироксина (T4) сыворотки крови
- Исследование уровня тиреотропина (ТТГ) в сыворотке крови
- Исследование уровня свободного трийодтиронина (T3) в крови Гормональное исследование крови – оценка функции щитовидной железы:
- Исследованиепоказателей состояния гемостаза
- Тромбоцитарно-сосудистый (тромбоциты)
- Коагуляционный (АПТВ, ПТИ, фибриноген)
- Продукты паракоагуляции (РФМК)
- Определение активированного частичного тромбопластинового времени,
- Определение протромбинового времени, протромбинового индекса и МНО,
- Определение фибриногена в плазме крови,
- Определение времени кровотечения,
- Определение времени свертывания цельной крови,
- Определение степени ретракции кровяного сгустка.
- Иммунологические исследования
- Определение общего иммунного статуса:
- — определение концентрации иммуноглобулинов класса: А, G, М в сыворотке крови;
- — определение основных субпопуляций Т – лимфоцитов (общие, активные, хелперы, супрессоры);
- — идентификация В – лимфоцитов;
- — НСТ — тест стимулированный туберкулином БЦЖ;
- Иммуногематологические исследования
- Определение групповой принадлежности по системе АВО.
- Определение резус-принадлежности.
- Фенотипирование
- Выявление и подтверждение наличия иммуноглобулинов классов G и М к вирусу гепатита С (ИФА).
- Выявление и подтверждение присутствия HBs- антигена (ИФА).
- Определение суммарных антител к Treponemapallidum(ИФА)
- Определение антител к Treponema pallidum IgG (ИФА)
- Определение антител к Treponema pallidum (РПГА)
- Реакция микропреципитации, качественный тест (РМП)
- Реакция микропреципитации, количественный тест – определение титра (РМП)
- Определение индекса авидности иммуноглобулинов класса G к цитомегаловирусу (ИФА)
- Выявление иммуноглобулинов класса М к цитомегаловирусу (ИФА)
- Выявление иммуноглобулинов класса G к капсидному антигену VCA вируса Эпштейна-Барр (ИФА)
- Выявление иммуноглобулинов класса М к капсидному антигену VCA вируса Эпштейна-Барр (ИФА)
- Выявление иммуноглобулинов класса G к ранним антигенам ЕА вируса Эпштейна-Барр (ИФА)
- Определение индекса авидности иммуноглобулинов класса G к вирусу простого герпеса 1 и 2 типов (ИФА)
- Выявление иммуноглобулинов класса М к вирусу простого герпеса 1 и 2 типов (ИФА)
- Выявление иммуноглобулинов класса G к Mycoplasma pneumoniae (ИФА)
- Выявление иммуноглобулинов класса М к Mycoplasma pneumoniae (ИФА)
- Определение индекса авидности иммуноглобулинов класса G к Toxoplasma gondii (ИФА)
- Выявление иммуноглобулинов класса М к Toxoplasma gondii (ИФА)
- Выявление иммуноглобулинов класса G к Chlamydophila pneumoniae (ИФА)
- Выявление иммуноглобулинов класса М к Chlamydophila pneumoniae (ИФА)
- Выявление иммуноглобулинов класса G к грибам рода Aspergillus (ИФА)
- Выявление иммуноглобулинов класса G к грибам рода Candida (ИФА)
- Выявление иммуноглобулинов класса М к грибам рода Candida (ИФА)
- Выявление иммуноглобулинов класса G к вирусу клещевого энцефалита (ИФА)
- Выявление иммуноглобулинов класса М к вирусу клещевого энцефалита (ИФА)
- Выявления иммуноглобулинов класса М к возбудителям иксодовых клещевых боррелиозов (болезнь Лайма) (ИФА)
- Выявления иммуноглобулинов класса G к возбудителям иксодовых клещевых боррелиозов (болезнь Лайма) (ИФА)
- Выявления специфических циркулирующих иммунокомплексов, содержащих антигены описторхисов (ИФА)
- Выявления иммуноглобулинов класса G к антигенам описторхисов (ИФА)
- Выявления иммуноглобулинов класса А, М, G к антигенам лямблий (ИФА)
- Выявление антител к вируса простого герпеса 1 и 2 типов
- Выявление антител к цитомегаловируса
- Выявление антител к вируса Эпштейн-Барра
- Выявление антител кcandida albicans
- Выявление антител к toxoplasma gondii
- Выявление антител к ВИЧ-1,2 и антигена р-24 к ВИЧ-1
Цитологические исследования
Исследование мокроты, промывных вод бронхов, плевральной жидкости, отпечатков бронхов, смывов мочевого пузыря, ликвора, отделяемого женских половых органов.
Микробиологические исследования методом классического посева и с использованием инновационных методов лабораторной диагностики туберкулеза
- Бактериоскопическое исследование диагностического материала на микобактерии туберкулеза.
- Посевы патологического материала на микобактерии туберкулеза.
- Определение лекарственной устойчивости выделенных культур к противотуберкулезным препаратам первого ряда и резервного ряда.
- Типирование микобактерий, относящихся к микобактериям туберкулезного комплекса методом ПЦР-диагностики.
- Посевы патологического материала на неспецифическую микрофлору с выделением чистой культуры и определением лекарственной чувствительности к антибактериальным препаратам;
- Экспресс-исследование мокроты на аппарате GeneXpert для выявления возбудителя туберкулеза и определение лекарственной чувствительности к римампицину;
- Исследование патологического материала на микобактерии туберкулеза методом ПЦР-диагностики;
- Посев на микобактерии туберкулеза и определение лекарственной устойчивости с использованием автоматизированной системы BACTEC MGIT 960;
- Прочие-бактериологические исследования.
Тест GenеXpert MTB/RIF
GeneXpert MTB/RIF – тест на наличие Mycobacterium tuberculosis и определение устойчивости к рифампицину в образцах мокроты. Он предназначен для использования с системой GeneXpert Dx, и использует метод полуколичественной гнездовой ПЦР в реальном времени, проводимой in vitro с целью обнаружения:
- ДНК Mycobacterium tuberculosis, являющейся кислотоустойчивой палочковидной бактерией, в образцах мокроты или концентрированных осадков мокроты, полученной после провокации или при кашле.
- Мутаций резистентности к рифампицину гена rpoB в образцах, полученных от пациентов с риском резистентности к данному препарату. Тест GeneXpert MTB/RIF может проводиться со свежей мокротой и с приготовленным осадком; результаты могут быть получены менее чем за 2 часа. Быстрое определение MБT и резистентности к рифампицину позволяет врачу сделать важный выбор относительно необходимой терапии во время одного посещения пациента.
Использование теста GeneXpert MTB/RIF позволяет с высокой степенью специфичности выявить микобактерии в течение короткого срока при наличии менее 10 микробных тел в 1 мл материала и, следовательно, по своей чувствительности данный тест значительно превосходит бактериоскопические и даже культуральные методы. Метод обеспечивает диагностику при сниженной жизнеспособности микобактерий.
Преимущества данного метода исследования:
- Чувствительность выявления ТБ: 92,5%, специфичность: 98%.
- Чувствительность для устойчивости к рифампицину: 98%, специфичность: 99%.
- Быстрота получения результата полного анализа (выделение возбудителя + определение его лекарственной чувствительности к рифампицину) — в течение 2-х часов.
Исследование на автоматизированной системе с использованием жидких сред
Сохранение напряженности эпидситуации по туберкулезу в Томской области во многом обусловлено наличием значительного числа больных остропрогрессирующими распространенными формами туберкулеза с массивным бацилловыделением, включая пациентов, страдающих лекарственно-устойчивыми формами заболевания.
Одной из основных задач диагностики туберкулеза является сокращение сроков выявления микобактерий туберкулеза и определения лекарственной чувствительности для своевременной госпитализации больного, назначения адекватного лечения и корректного применения антибактериальных препаратов.
В целях улучшения микробиологической диагностики туберкулеза при первичном обследовании больных туберкулезом бактериологическая лаборатория ОГБУЗ «ТФМЦ» проводит исследования на микобактерии туберкулеза с использованием автоматизированной системы BACTEC MGIT 960. Приборы, которыми располагает лаборатория, позволяет на качественно высоком уровне проводить идентификацию микобактерий туберкулеза и определять их чувствительность к противотуберкулезным препаратам в максимально короткие сроки.
Действие системы основано на регистрации флюоресценции, возникающей при поглощении растущими микобактериями кислорода из пробирок. Положительный рост микобактерий может наблюдаться уже на 4-10 сутки максимальный протокол исследования 42 дня, для сравнения, при классической методике исследования видимый рост микобактерий появляется через 3 недели, а отрицательный результат выдается через 12 недель (90 дней). Исследуется любой диагностический материал кроме крови и мочи.
В среднем полное обследование одного бактериовыделителя с определением чувствительности к противотуберкулезным препаратам первого ряда выполняется за 2-4 недели. Данная методика поглощает все недостатки классического метода посева на плотные питательные среды и позволяет в кратчайшие сроки провести дифференциальную диагностику туберкулеза от неспецифической патологии, правильно выбрать тактику ведения больного.
Исследования с помощью молекулярно-генетических методов
Благодаря повышенному вниманию к проблеме туберкулеза достигнуты значительные успехи в молекулярно-биологических исследованиях микобактерий туберкулеза. Метод ПЦР является наиболее эффективным методом среди методов молекулярной диагностики. Использование этого метода позволяет с высокой степенью специфичности выявить микобактерии в течение короткого срока при наличии 10 клеток в 1 мл. материала и следовательно по своей чувствительности значительно превосходит бактериоскопические и даже культуральные методы. Метод обеспечивает диагностику при сниженной жизнеспособности микобактерий. Некоторые данные свидетельствуют о высокой эффективности ПЦР-анализа для диагностики туберкулеза мочевой системы и туберкулеза мужских половых органов. Быстрота проведения анализа (1-2 дня) чрезвычайно ценна для клинической практики.
Сочетание ПЦР-анализа с культивированием диагностического материала с использованием автоматизированной системы BACTEC MGIT 960 позволяет оценивать эффективность лечения, особенно у больных с ограниченными формами туберкулеза.
Контроль качества исследований, проводимых в лаборатории
Систематическое проведение внутри лабораторного, межлабораторного контроля качества и участия в ФСВОК осуществляется в соответствии с приказами Минздрава РФ от 21.12.1993 № 295, от 19.02.1996 № 60, от 25.12.1997 № 380, от 7.02.2000 № 45.
В КДЛ постоянно проводится внутрилабораторный контроль качества биохимических и клинических исследований с использованием стандартных и контрольных сывороток. Достоверностью результатов исследований, подтвержденных Федеральной системой внешней оценки качества (ФСВОК), а так же региональной референс-лабораторией Новосибирского НИИТ, а также ежедневным проведением и мониторингом качества всех исследований (биохимических и клинических исследований с использованием стандартных и контрольных препаратов), участием в межлабораторном контроле качества исследований.
В соответствии с требованиями современной доказательной медицины, в работе КДЛ используются теоретические и практические достижения медицинских наук, внедряются новые методы диагностики, улучшая тем самым качество лабораторных исследований.